/etc/localtime がタイムゾーンを司るファイル。元となるファイル地域別に /usr/share/zoneinfo/ 以下にあるので、適切なものを指すようにしてあげればよい。

Japan にする場合は、こんなかんじでOK

$ sudo rm /etc/localtime
$ sudo ln -s /usr/share/zoneinfo/Japan /etc/localtime